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降低整体电荷TMPyP4提高其选择性G-Quadruplex DNA

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出版日期

1-1-2017

发表在

Biochimie

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配体稳定非规范DNA结构称为G-quadruplexes (《GQ》)可能应用在医学作为抗癌剂,由于《GQ》DNA参与各种各样的癌症相关的生物过程。20-tetrakis衍生品的5、10、15日(N-methyl-4-pyridyl)卟啉(TMPyP4),一个N-methylpyridyl组取代苯基(4 p3) 4-aminophenyl (PN3M) 4-phenylamidoproline (PL3M),或4-carboxyphenyl (PC3M和P2C2M)追究他们的交互与人类端粒DNA (Tel22)使用荧光共振能量转移(FRET)测定,紫外可见和圆二色性光谱在K +缓冲。分子阳离子或两性离子的总负责3 + (4 p3, PN3M, PL3M), 2 + (PC3M)或中性(P2C2M)。卟啉除了P2C2M稳定人类端粒DNA的烦恼化验∼20°C 5 eq CD融化实验表明4 p3是最稳定配体稳定温度为16.8°C 4 eq。重要的是,4 p3, PC3M和PL3M展示优秀的四倍的选择性,远优于TMPyP4。结合常数,确定使用紫外滴定,与电荷:三重阳离子4 p3, PN3M和PL3M显示5 - 9的KaμM−1,双阳离子PC3M显示Ka 1μM−1和中性P2C2M显示weak-to-no绑定。常用的数据表明,绑定交互是由静电吸引力和绑定模式可能base-stacking(或end-stacking)从高的红移值(15 - 20 nm)和减色性(40 - 50%)。我们得出结论,降低电荷TMPyP4 3 +可以达到预期的稳定之间的平衡能力,亲和力和高选择性需要一个优秀的四倍的配体。

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